Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms