Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms