Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms