Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF18Q5VWM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms