Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms