Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP6Q5VW22 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms