Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms