Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms