Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms