Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms