Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms