Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms