Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms