Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms