Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms