Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms