Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC27Q2M243 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms