Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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