Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST2H2ACQ16777 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms