Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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GABRA6Q16445 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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GABRA6Q16445 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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GABRA6Q16445 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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