Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTRK3Q16288 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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