Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CDSNQ15517 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDSNQ15517 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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