Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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