Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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