Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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