Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39AQ14964 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39AQ14964 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms