Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS1Q14691 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms