Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIDRQ14159 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SPIDRQ14159 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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