Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE4AQ14139 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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