Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
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CNGB1Q14028 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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CNGB1Q14028 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
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