Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOFQ13790 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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