Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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