Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PKD2Q13563 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms