Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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