Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms