Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4BQ07343 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 783.5 ms