Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL16A1Q07092 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms