Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EXOSC9Q06265 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms