Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms