Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms