Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG6Q00889 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG6Q00889 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms