Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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