Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPCAP84074 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPCAP84074 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPCAP84074 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPCAP84074 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms