Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX1P83916 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX1P83916 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms