Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVK-24P63145 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms