Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSCP56915 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSCP56915 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSCP56915 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSCP56915 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSCP56915 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSCP56915 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms