Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEMP55040 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEMP55040 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEMP55040 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEMP55040 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEMP55040 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEMP55040 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GEMP55040 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GEMP55040 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GEMP55040 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GEMP55040 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GEMP55040 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms