Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRAP54198 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRAP54198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRAP54198 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRAP54198 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRAP54198 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRAP54198 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms