Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA4P51532 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms