Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP4P49662 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP4P49662 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP4P49662 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms